Eğer karaciğer absesi bakteriden kaynaklanıyorsa, doktor akıtılıp temizlenmesi için kateterizasyon ve üç beş hafta damardan antibiyotik verilmesini önerebilir. Bazen cerrahi müdahale ile absenin akıtılıp temizlenmesi ve hatta karaciğerde absenin bulunduğu kısmın kesilip alınması gerekli olabilir. Eğer neden amip veya Echinococcus (ekinokok) İse doktorunuz özel ilaçönerebilir.