Bu uygulama sırasında verilen ilaçlar yorgunluk, baş dönmesi, ağız kuruluğu yapabilir. Bazen biraz mide bulantısı da olabilir. Bağırsaklara verilen hava üç-beş saat kendinizyşişmiş ve gazlı hissetmenize sebep olur.J(üsma refleksi geri gelinceye kadar hiçbir şey yiyip içmeyin. Bir iki gün boğazınız sızlayabilir. Bunun için tuzlu suyla gargara yapabilir veya pastiller alabilirsiniz. Tüm ERCP'nin uygulanma süresi 30 dakika ila 1 saat arasındadır ve ayakta tedavi sayılır. Aynı gün eve dönebilirsiniz.